支線任務部分和前作一樣，必須完成的強制性主線與可自由選擇的各種支線應有盡有。除此之外，在自由行動日與隊友一同進行舊校舍的探索也是個不錯的選擇。

另一個要提到的就是“特別實習”，黎恩與其他隊友們將被分成2組，在日本各地完成不同的委托才能通關。在各地實習的過程中，主人公們將被卷入各種各樣的事件之中。在某種意義上講，這屬于軌跡系列的固定套路。

游戲中還有一個令人印象深刻的要素，那就是在世界各地鋪設的鐵路交通網(wǎng)。本作中較大城市之間的交通基本上采用鐵路，由于連接城市之間的道路會有魔獸出現(xiàn)，通過街道來旅行的市民并不多。

不僅在城市內(nèi)可以接到任務，在郊外也會有很多委托，在郊外的一些交通要道上，經(jīng)常會有很多魔獸出現(xiàn)。委托的任務大多是剿滅那些中大型魔獸，其中會有一些敵人非常強力，玩家一定要作好萬全的準備。